我現在在產業界工作。就算不在學術界,讀文獻還是日常。
網路上的研究工具很多,問題是你不知道哪一個做什麼、什麼時候該用它。
所以我照大部分人的研究流程走一遍:找文獻、讀文獻、整理文獻、資料分析、寫作投稿,一直到投稿前的引用查證,每個階段列出用得上的工具。
我雖然是生醫領域,但裡面不少工具跟該領域無關,你不是生醫領域也用得上。
- 搜尋文獻
- 讀文獻與筆記
- 整理文獻
- 資料分析與方法
- 寫作與潤飾
- 引用與可信度查證
這兩段沒有固定位置
- 法規與臨床資料庫:藥物開發與臨床端才會固定用到,學術研究不一定會用到。
- 通用 AI 助理:整個研究工作流都用得到。
最後更新 2026-08-20
標「機構授權」不代表你用不到。有些學校會訂閱這些資料庫,用學校網路、學校帳號或信箱就能使用;付費之前先查一下你的機構有沒有訂閱。
目前的篩選組合沒有符合的工具。
搜尋文獻 (19)
把模糊的題目變成一份查得到出處的文獻清單
PubMed
專門用來找生物醫學和生命科學的文獻、摘要與書目
這個資料庫收錄超過三千萬筆論文與書籍摘要,涵蓋臨床醫學、護理、牙醫、獸醫與公共衛生等領域。
什麼時候用AI 給了你一份文獻清單,想確認那些論文真的存在。
提醒:查詢語法不直覺,要讓搜尋更精確,得用進階檢索組出複雜的條件。
Consensus
查一個說法在論文中有多少支持、多少反對
AI 學術搜尋引擎,索引超過兩億篇論文。用問句提問,它會從論文裡把結論撈出來,統計支持與反對的比例,每一條都附原始論文連結。
什麼時候用想確認一個常聽到的說法,在研究上到底站不站得住。
提醒:免費版每天搜尋次數有限。統計出來的是文獻的傾向,不是定論,重要的結論還是要回原文讀過。
站內相關文章:
BenchSci
查一支抗體或試劑在哪些已發表的實驗中被驗證過
用機器學習讀過數千萬篇論文與廠商目錄,整理出每支抗體被用在哪些細胞株、哪些應用條件下,並附上出處。重組蛋白、RNAi、細胞株與動物模式也查得到。
什麼時候用要訂抗體,想先看有沒有人在跟你相同的細胞株與條件下用過。
提醒:學術與非營利研究者免費,產業界研究者要付費。
Elicit
把一批論文的方法與結果抽成可比較的表格
依你的研究問題找出相關論文,把每篇的樣本數、族群、主要結果等欄位抽出來排成一張表,也支援系統性回顧的逐篇篩選。
什麼時候用要做系統性回顧,得把幾十篇論文的方法與結果攤成一張表。
提醒:免費版每月的報告數與表格欄位有限。抽出來的欄位要抽幾篇回原文核對,不能直接引用。
Semantic Scholar
免費的學術搜尋引擎,多數 AI 文獻搜尋工具的資料庫
由 Allen Institute for AI 維護,收錄兩億筆以上論文。除了搜尋,還看得到別人引用一篇論文時是在哪一段、用什麼語氣提到,也開放 API 讓人批次取用資料。
什麼時候用想看出一個主題裡誰在引用誰、哪幾篇是多數人都會引的。
Google Scholar
覆蓋最廣的免費學術搜尋
期刊論文、學位論文、研討會論文、專利與預印本都收,也看得到一篇論文的被引用次數與引用它的清單。
什麼時候用剛接觸一個新題目,想先知道有沒有人做過。
提醒:不能照研究類型、受試族群這些條件篩選,結果只能一筆一筆看。收錄門檻寬鬆,掠奪性期刊(付錢就刊、幾乎不審查的期刊)也會出現在結果裡。
Undermind
花幾分鐘反覆檢索,挖出關鍵字搜尋漏掉的文獻
不追求秒回。它會讀摘要、追引用,再依讀到的內容修正檢索方向,這樣跑好幾輪,最後給一份論文清單,並估計這次找得多完整。
什麼時候用關鍵字都試過了,還是找不到對的文獻。
提醒:免費版每月的深度檢索次數很少。它讀的是摘要與書目資料而不是全文,適合摸清一個領域,不適合當定稿的唯一依據。
Embase
藥物與不良反應的文獻覆蓋比 PubMed 廣
Elsevier 的生醫與藥學文獻資料庫,藥物、醫療器材與不良反應的收錄範圍比 PubMed 廣,另收大量研討會摘要,有些研究只在這裡查得到。
什麼時候用要做正式的系統性回顧,審稿人會檢查你查過哪幾個資料庫。
提醒:要機構訂閱。多數大學圖書館有買,用學校帳號就能登入。
SciFinder / SciFinder-n
用結構式查一個化合物有沒有人合成過
美國化學會 CAS 的化學檢索平台,可以直接畫結構式來搜尋,查得到合成反應、物質資料與專利化學,專利的收錄深度是一般文獻資料庫沒有的。
什麼時候用手上有一個結構式,想知道有沒有人合成過、怎麼合成的。
提醒:要機構訂閱,多數理工與生醫學院圖書館有。授權通常限制同時上線人數,尖峰時段可能要等。
Reaxys
查合成路徑、物理性質與生物活性數據
Elsevier 的化學反應與物質資料庫。除了知道某個反應存在,還查得到實驗條件、產率、物理性質與生物活性數據,也提供 AI 輔助的合成路徑規劃。
什麼時候用要規劃一條合成路徑,需要具體的反應條件與產率。
提醒:要機構訂閱。與 SciFinder 收錄的來源不完全一樣,重要的檢索兩邊都跑一次比較保險。
PubTator 3.0
把論文裡的基因、疾病與化合物標成可以直接查的關鍵詞
NCBI 官方做的文獻工具,事先把基因、變異、疾病、化合物這些名詞標註在三千六百萬筆 PubMed 摘要與六百萬篇 PMC 全文上,所以同一個基因的各種寫法都能一次撈到。
什麼時候用要找某個基因跟某個疾病一起出現的文獻,但同義詞太多,關鍵字搜尋一定會漏。
ResearchRabbit
從幾篇論文出發,展開一張引用關係圖
放進一兩篇當起點的論文,它用引用關係向外長成一張網路圖,找出關鍵字搜尋不會跑出來的相關研究。可以跟 Zotero 同步。
什麼時候用剛進一個新領域,手上只有兩三篇論文,想知道這個領域還有誰。
提醒:核心功能永久免費,包含無限次搜尋、無限個 library 與最多 50 篇起點論文。付費版年繳約每月 10 美元,起點論文上限提高到 300 篇。
Connected Papers
輸入一篇論文,畫出周邊相似研究的關聯圖
用一篇論文當種子,畫出周邊數十篇的相似度圖譜,看得出哪幾篇是這個領域的奠基文獻、哪些是後來的衍生研究。操作比 ResearchRabbit 簡單,適合一次性的快速掃描。
什麼時候用寫文獻回顧,想確認自己沒漏掉領域裡公認的那幾篇。
提醒:免費版每月能產生的圖有次數限制。
Web of Science
查正式的引用次數、期刊分區與 h-index
Clarivate 的引用索引資料庫,收錄門檻比 Google Scholar 嚴格,提供影響因子、被引用分析與期刊分區。學位論文、計畫書與升等資料常指定用這裡的數據。
什麼時候用要一份拿得出去的引用數據,寫進計畫書或升等資料。
提醒:要機構訂閱,多數大學圖書館有。與 Scopus 收錄範圍不同,同一篇論文的引用數會對不起來,正式引用時要註明查的是哪一個資料庫。
Scopus
另一套引用索引,非英語系與新興期刊收得比較全
Elsevier 的引用索引資料庫,期刊收錄範圍比 Web of Science 廣,尤其是非英語系與比較新的期刊。提供 CiteScore 等指標,很多機構評鑑也採用它的數據。
什麼時候用投稿前想確認目標期刊被收錄的狀態與影響力。
提醒:要機構訂閱。數據常與 Web of Science 有出入,引用時要註明來源。
Europe PMC
可以搜全文的生命科學文獻資料庫
歐洲的生命科學文獻資料庫。除了 PubMed 的內容,還收預印本、專利、臨床指引與研究資料集,而且能搜到全文,不只標題與摘要。
什麼時候用要找方法段裡提到某個試劑這種只寫在內文的東西。
STORM
產出一篇帶引用的主題綜述,當作進入新題目的起點
史丹佛 OVAL 實驗室的開源系統。給它一個主題,它會先上網檢索、從不同角度自問自答,再寫成一篇維基百科式的長文,每一段都附上來源連結。
什麼時候用完全陌生的主題,想先知道它有哪些子題、有哪些來源可以讀。
提醒:它的定位是研究原型,產出的是探索用的初稿,不是可以直接發表的內容,每一條引用都要自己點開確認。
Unpaywall
在付費牆頁面自動找出合法的免費全文
由非營利組織 OurResearch 維護的開放資料庫,收錄五千六百多萬篇免費取得的論文,來源涵蓋五萬多家出版社與典藏庫。裝上瀏覽器擴充功能後,遇到付費牆會自動幫你找作者自存版或機構典藏的合法版本。
什麼時候用沒有機構訂閱,又需要讀那篇被鎖住的論文。
提醒:只找得到合法的開放版本,沒有就是真的沒有,它不碰盜版來源。
Cochrane Library
方法最嚴謹的系統性回顧資料庫
Cochrane 組織出版的實證醫學資料庫,核心是一批方法學要求很高的系統性回顧,另外還有隨機對照試驗的登錄資料庫。
什麼時候用動手做自己的回顧之前,先查有沒有人做過同一題。
提醒:要機構訂閱,多數醫學院圖書館有;部分國家有全國授權可以免費使用。
讀文獻與筆記 (5)
下載了不等於讀過
Gemini Notebook(原 NotebookLM)
只根據你上傳的文獻回答,不會亂接網路資料
Google 的筆記型 AI 助理,2026 年 7 月由 NotebookLM 改名。所有回答只根據你上傳的檔案,每句都點得回原文段落。支援 PDF、Google 文件、網頁與影片,也能生成摘要、簡報與語音導覽。
什麼時候用口試前有三十篇論文要讀,想跨篇問答又不希望答案混進來源以外的東西。
提醒:Google 標示上傳內容預設不用於訓練基礎模型,但個人帳號與學校、企業帳號的條款不同,未發表數據上傳前先確認自己登入的是哪一種。
沉浸式翻譯 Immersive Translate
網頁與 PDF 的雙語對照翻譯
瀏覽器擴充功能,在原網頁上直接把譯文排在原文旁邊,PDF、EPUB 與影片字幕也能翻,PDF 還保留原本排版。可以接 DeepL、OpenAI、Claude、Gemini 等二十多種翻譯引擎。
什麼時候用讀英文論文速度跟不上進度,又不想整篇只看中文翻譯。
提醒:免費版用內建引擎,品質大概等同 Google 翻譯,接自己的 API 金鑰會明顯變好。PDF 表格的排版容易跑掉。
SciSpace
上傳論文後針對段落提問,答案標出原文位置
反白看不懂的段落直接問,回答會標示是從原文哪個部分來的。另外還有文獻檢索、資料萃取與引用生成,讀跟查在同一個工作區完成。
什麼時候用卡在看不懂的方法段或統計處理,自己 Google 名詞太慢。
提醒:AI 的解釋還是會出錯,關鍵的方法細節要回頭核對原文。
Scholarcy
把長論文拆成重點摘要卡片
上傳論文後自動抽出研究問題、方法、主要發現與限制,整理成一張張重點卡片,並列出參考文獻連結。
什麼時候用一次下載二十篇論文,要先分出哪幾篇值得精讀。
提醒:卡片是用來判斷要不要精讀的,不能取代讀原文,方法與限制的細節尤其要自己看。
ChatDOC
對 PDF 提問,答案可以跳回原文那一段
文件問答工具,回答時直接標出來源在 PDF 的哪一段,點一下就跳過去。可以同時對多份文件提問,表格也讀得出來。
什麼時候用要在幾百頁的指引或論文集裡找一句話,而且要記得它在第幾頁。
提醒:功能與 SciSpace 高度重疊,兩個擇一就好。
整理文獻 (5)
引到的東西要真的存在
Zotero
免費開源的文獻管理軟體,資料留在自己電腦
由非營利組織開發,瀏覽器一鍵抓下書目與 PDF,寫作時在 Word、LibreOffice 或 Google 文件插入引用並自動排好參考文獻,支援上萬種格式。核心功能完全免費,資料預設存在本機。
什麼時候用第一次建立自己的文獻庫,或不想再手動排參考文獻。
提醒:本身沒有 AI 功能,要另外裝外掛。免費雲端空間只有 300MB,一篇學位論文的 PDF 就可能塞滿。
EndNote
與 Word 整合最成熟的老牌文獻管理軟體
與 Microsoft Word 的整合最完整,投稿格式範本最齊全,部分出版社只提供 EndNote 的樣式檔。介面較舊,但在某些系所仍是慣例。
什麼時候用系上或指導教授指定用它,或期刊只給 EndNote 樣式檔。
提醒:個人授權價格偏高,但多數大學有校園授權可以免費拿,先問圖書館。
Mendeley
PDF 閱讀與註記體驗較好的免費文獻管理
Elsevier 旗下的文獻管理工具,提供 2GB 免費雲端空間,內建的 PDF 閱讀器與註記功能比 Zotero 完整,也能跟 Word 整合。
什麼時候用大多數論文都在電腦上直接畫線註記,需要註記跟著文獻庫一起同步。
提醒:屬於 Elsevier,而 Elsevier 本身是學術出版商,介意自己的閱讀紀錄被出版社掌握的人要自己評估。
Paperpile
在 Google 文件裡寫論文最順的文獻管理
圍繞 Google 文件與雲端硬碟設計,在 Google 文件裡插入引用、生成參考文獻清單的流暢度是同類工具裡最好的。
什麼時候用論文跟研究筆記都寫在 Google 文件,還要跟指導教授即時共編。
提醒:沒有免費方案。主要用 Word 寫作的話,Zotero 或 EndNote 的整合更完整。
JabRef
給 LaTeX 使用者的免費開源書目管理
直接操作 BibTeX 檔案,資料是純文字,可以進 Git 版控,完全在本機運作,接進 LaTeX 的寫作流程很自然。
什麼時候用用 LaTeX 寫論文,希望書目檔跟程式碼一起版控。
提醒:介面陽春,不用 LaTeX 的人沒必要選它。
資料分析與方法 (12)
讓別人照你的步驟做,也能得到一樣的結果
Julius AI
用講話的方式問資料,它自己寫程式跑統計
上傳 CSV、Excel 或接上資料庫後用中文或英文提問,它會自動寫並執行 Python 或 R,回傳圖表、統計檢定與說明,程式碼也看得到。
什麼時候用拿到一份實驗數據想先跑跑看,還不確定該用哪種檢定。
提醒:官方沒有明確承諾資料不會用於訓練模型。複雜的迴歸與預測模型,建議請有統計背景的人再看一次。
ChatGPT 進階資料分析
不用裝任何軟體就能開始跑的資料分析
ChatGPT 內建的程式執行環境,上傳資料檔後由它寫 Python 做清理、統計與繪圖,你可以看到也可以改它寫的程式碼。
什麼時候用合併好幾個 Excel、處理缺失值這種一次性雜事,不值得自己寫程式。
提醒:資料會不會被拿去訓練,取決於你的帳號設定與方案,上傳未發表數據前先確認一次。
Claude Code
用來寫可以重跑的 R 與 Python 分析腳本
在終端機裡運作的 AI 編碼工具,可以直接讀寫專案裡的檔案、執行程式、看到錯誤再自己修。比起在聊天視窗貼程式碼,更適合建立能版控、能重跑的分析流程。Anthropic 另外推出給科學家用的 Claude Science,把基因體、單細胞、蛋白質體與化學資訊的常用工具整合進同一個環境,產出的每張圖都附上產生它的程式碼與執行環境,幾個月後要重現也對得回來。
什麼時候用分析流程要寫進方法段,別人得能照著重跑一次。
提醒:需要基本的命令列操作能力。分析邏輯對不對還是要自己把關。Claude Science 目前是 beta,只有 macOS 與 Linux 版,且要 Pro、Max、Team 或 Enterprise 方案。
GraphPad Prism
生醫論文統計圖表的通用軟體
生醫領域最普遍的統計與繪圖軟體,內建符合生物實驗設計的統計流程與圖表樣式,像劑量反應曲線、存活曲線這類圖,輸出後可以直接投稿。
什麼時候用要畫出審稿人預期看到的那種標準生醫圖表。
提醒:商業軟體,但多數大學或系所有校園授權,先問實驗室或圖書館。
R / RStudio
免費開源的統計分析環境,分析過程留在程式碼裡
開源統計語言與它的編輯環境,生物統計與生物資訊的套件最齊全。分析步驟全部寫成程式碼,換一台電腦也跑得出同樣的結果。
什麼時候用分析要寫進方法段,或需要用領域特定的生物統計套件。
提醒:學習曲線陡。可以先讓 AI 產一版程式碼,再自己讀懂、改對。
AlphaFold Server
預測蛋白質與複合體的立體結構
DeepMind 提供的網頁工具,用 AlphaFold 3 預測蛋白質,以及它跟 DNA、RNA、小分子結合在一起的結構。每個預測都附一張信心分數圖,看得出哪些區域可信、哪些是猜的。
什麼時候用做實驗前想先看這個蛋白質大概長什麼樣、哪一段是鬆散無序的。
提醒:只限學術非商業用途,每天能送出的預測次數有限。信心分數低的區域不能當成可信結構使用。
AlphaFold Protein Structure Database
兩億筆已經算好的蛋白質結構,直接查就有
DeepMind 與 EMBL-EBI 合作的公開資料庫,幾乎所有已知蛋白質的預測結構都收在裡面,常見的蛋白質不必自己跑,查到直接下載。
什麼時候用研究對象是人類或常見模式生物的蛋白質。
提醒:收的是單一蛋白質的結構。要看複合體或跟小分子結合的樣子,得改用 AlphaFold Server 或其他工具。
Boltz
開源的結構預測模型,可以裝在自己的機器上跑
能力接近 AlphaFold 3,但採開放授權,可以裝在自己的電腦或叢集上,不受商業用途限制,序列也不用上傳到別人的伺服器。
什麼時候用要大量跑結構預測,或序列還沒發表、不方便上傳。
提醒:需要 GPU,也需要一點環境建置的能力。
RoseTTAFold
開源結構預測,適合接進自己的運算流程
華盛頓大學 Baker 實驗室開發的開源結構預測模型,程式碼公開,後來也長出蛋白質設計等應用,可以嵌進更大的計算流程。
什麼時候用結構預測只是流程的一環,後面還要接蛋白質設計。
提醒:環境建置與運算資源的門檻較高,適合有計算背景或有叢集可用的實驗室。
PyMOL / ChimeraX
看結構、標結合位點、產出論文等級的圖
兩套主流的分子視覺化軟體,用來檢視結構、標註結合位點、輸出論文圖片。ChimeraX 由 UCSF 開發,處理大型複合體與冷凍電鏡資料比較順。
什麼時候用拿到預測或實驗結構,要做一張放得進論文的結構圖。
提醒:ChimeraX 學術使用免費;PyMOL 分開源版與商業版,用之前先確認授權。
ImageJ / Fiji
顯微影像定量分析的開源標準工具
NIH 支持開發的開源影像分析軟體,Fiji 是先把常用外掛打包好的版本。螢光強度定量、細胞計數這類分析,多數生醫實驗室都從這裡開始。
什麼時候用要對顯微影像做定量,而且步驟得寫進方法段讓人重複。
提醒:分析參數會明顯影響結果。先把流程固定下來再套到全部影像,不要看到結果不喜歡再回頭調參數。
Cellpose
自動框出影像中的細胞與細胞核
用深度學習做細胞與細胞核分割的開源工具,不必為每一組資料重新訓練就有不錯的表現,也可以用自己的標註資料再微調。
什麼時候用要在幾百張顯微影像裡數細胞,手動框已經不可能。
提醒:分割結果要抽樣人工檢查,細胞密集重疊的地方最容易出錯。
寫作與潤飾 (11)
從實驗紀錄、內部報告與 SOP,到要投出去的論文
Paperpal
用學術論文語料訓練的英文潤飾與投稿檢查
學術寫作助理,訓練語料以已發表論文為主,提供文法潤飾、改寫、抄襲檢查、翻譯與投稿前的格式檢查,可以在 Word、Google 文件、瀏覽器與 Overleaf 裡直接用。
什麼時候用要潤飾投稿用的英文摘要,或送出前跑一次格式檢查。
提醒:免費版每天的 AI 使用次數與潤飾字數有上限。
Grammarly
最普及的英文文法即時檢查
通用型英文寫作助理,即時抓文法、拼字、標點與語氣問題,瀏覽器、Word 與多數編輯器都能裝。不是學術專用,但日常英文的覆蓋面最廣。
什麼時候用寫給指導教授或國外合作者的英文信、投稿信、會議摘要。
提醒:對學術寫作慣例的掌握不如 Paperpal 或 Trinka,論文正文建議再過一次學術專用的工具。
DeepL / DeepL Write
中英互譯品質穩定,也能改寫英文句子
翻譯服務與寫作改寫工具,中英互譯讀起來比一般機器翻譯自然。DeepL Write 可以針對已經寫好的英文,給更道地的改寫建議。
什麼時候用想確認自己寫的英文句子,母語者聽起來自不自然。
提醒:免費版有字數限制,而且免費版與付費版的資料保存政策不同,未發表內容要留意。專有名詞的翻譯一定要自己確認。
Turnitin
學位論文送審前的相似度比對
學術原創性檢測服務,比對範圍涵蓋已發表文獻、網頁與學生繳交的作業庫,近年也加了 AI 生成內容偵測。多數大學的學位論文送審流程會要求跑過。
什麼時候用學位論文口試前,系上要求附相似度報告。
提醒:個人買不到,要透過學校帳號。相似度百分比只是參考,真正要看的是逐段比對報告;AI 偵測結果會誤判,不能單獨當判定依據。
Writefull
裝在 Overleaf 或 Word 裡的學術英文建議
以已發表論文為語料的寫作輔助工具,會告訴你某個表達在真實論文裡出現得多不多,也能生成標題與摘要建議。與 Overleaf 整合完整。
什麼時候用不確定某個詞組在論文裡到底該怎麼寫才道地。
提醒:免費版每天各項功能都有配額。
Trinka AI
針對學術寫作的英文文法檢查
專為學術與技術寫作設計的英文校對,會看學科的用語慣例,也提供投稿前檢查。定位與 Paperpal 相近,可以互相比較。
什麼時候用需要學術等級的文法檢查,但預算有限。
QuillBot
改寫句子與壓縮字數
改寫與摘要工具,可以調整正式程度與長度,也附文法檢查與引用生成。最常見的用途是把太長的段落壓進期刊的字數限制。
什麼時候用摘要超過期刊規定的 250 字,得砍字又不能砍掉資訊。
提醒:改寫很容易讓意思悄悄跑掉,改完要逐句確認科學陳述沒有被改變。拿它來規避抄襲檢測是學術不端。
Overleaf
線上寫 LaTeX,不用自己裝環境
瀏覽器上的 LaTeX 編輯與協作平台,內建大量期刊與學位論文範本,可以多人即時共編、比對版本。
什麼時候用論文得用 LaTeX,又不想在自己電腦上折騰安裝。
提醒:免費版的協作人數與編譯時間有限制。多數大學有機構授權可以升級。
JANE (Journal/Author Name Estimator)
貼上摘要,找主題相近的期刊
荷蘭 Biosemantics 團隊維護的免費工具,把標題或摘要貼進去,它比對 PubMed 的內容,推薦主題相近的期刊、作者與論文。
什麼時候用論文寫完了,還沒決定要投哪一本。
提醒:推薦只是參考,期刊的收錄範圍、影響力、是不是掠奪性期刊,仍要自己查證。
Notion
把實驗紀錄、進度與 SOP 收在同一個工作區
同一個頁面可以當文件寫,也可以轉成有欄位、能排序篩選的資料庫,頁面之間互相連結。內建的 Notion AI 能改寫、摘要與翻譯,介面有繁體中文。
什麼時候用實驗紀錄、會議筆記與 SOP 散在一堆檔案裡,想收進同一個地方。
提醒:免費版的 Notion AI 只有限量試用,完整功能要 Business 方案(每人每月 20 美元)。只有 Enterprise 方案標示與模型供應商之間零資料保留,未發表數據上傳前先確認學校規定。
Benchling
實驗紀錄、序列設計與結果放在同一套系統
生技研發用的雲端平台,核心是電子實驗記錄本,另外附 CRISPR、選殖、序列比對與引子設計工具。紀錄、序列與結果彼此連結,並自動留下時間與版本。
什麼時候用實驗紀錄還在紙本或 Word,序列檔跟結果對不太起來。
提醒:學術研究者可以免費使用,業界與企業版是客製報價。資料存在雲端,未發表數據上傳前先確認學校與實驗室的規定。
引用與可信度查證 (3)
投稿前確認自己引到的東西站得住腳
Scite
看一篇論文的結論被後續研究支持還是推翻
把每一次引用分成支持、反對與單純提及三類,所以你看到的不只是被引用幾次,還有這些引用到底在說什麼。Reference Check 可以一次掃過整份手稿的引用清單。
什麼時候用想確認自己要引的那篇經典,後來有沒有被推翻。
提醒:只有 Basic 與 Pro 兩種付費方案,沒有免費版。新用戶有七天試用,試用結束會自動轉成正式訂閱,不想續訂要在期限內自己取消。學生向所屬機構推薦後可以索取折扣碼。引用的分類是系統自動判的,關鍵結論還是要自己讀原文。
Retraction Watch Database
用 DOI 查一篇論文有沒有被撤稿
收錄超過六萬六千筆撤稿的資料庫,2023 年被 Crossref 買下後完全免費開放,可以用 DOI、標題或作者查,並標示撤稿原因。
什麼時候用投稿前最後一輪檢查參考文獻。
提醒:不是所有撤稿都收得到,資料與 Crossref 之間也有時間差,重要的引用建議再查一次出版社官網。
PubPeer
論文發表後的公開質疑平台
匿名的發表後評論平台,研究者在上面指出論文的圖片重複、統計錯誤與數據疑點。不少後來正式撤稿的論文,最早的疑點都是在這裡被提出來的。
什麼時候用整個研究方向壓在某幾篇關鍵論文上,想確認有沒有人公開質疑過。
提醒:評論是匿名的、也沒有經過正式審查,被質疑不等於論文有問題,要自己判斷評論講的技術依據站不站得住。
法規與臨床資料庫 (4)
查藥物核准、試驗登錄與仿單,偏產業與臨床端
ClinicalTrials.gov
查一個題目有誰做過、做到哪一期、有沒有中止
美國國家醫學圖書館維護的臨床試驗登錄資料庫,收錄全球數十萬筆試驗的設計、納入條件、主要指標與執行狀態,部分試驗還附結果數據。
什麼時候用研究題目有臨床對應,想先看有沒有人做過同樣的試驗。
提醒:資料由試驗主持方自己填報,完整度與更新頻率不一,有些試驗結束多年狀態還沒更新。
openFDA / Drugs@FDA
查藥品核准紀錄、仿單與不良事件通報
美國 FDA 的公開資料入口,涵蓋 1939 年以來的藥品核准紀錄、審查文件、仿單與不良事件通報,也提供開放 API 可以批次查詢。
什麼時候用要查一個藥物的核准適應症,或當初審查時被提過哪些疑慮。
提醒:FDA 明確聲明這些資料不能拿來做醫療決策。不良事件是自願通報,有明顯的通報偏差,不能直接推論因果。
DailyMed
查美國藥品仿單的完整原文
美國國家醫學圖書館維護的藥品仿單資料庫,收錄十五萬筆以上藥廠送交 FDA 的產品標示,處方資訊與歷史版本都查得到。
什麼時候用要引用一個藥物的官方適應症、劑量或警語原文,不想用二手轉述。
提醒:只收送交美國 FDA 的標示,其他市場的產品資訊要查當地主管機關。
衛福部食藥署藥品許可證查詢
查一個藥物在台灣有沒有核准、核准了什麼適應症
衛福部食藥署的西藥、醫療器材與化粧品許可證資料庫,查得到核准狀態、適應症、劑型與許可證有效期間,介面是中文。
什麼時候用研究牽涉台灣本地的臨床應用或法規。
提醒:台灣核准的適應症常與美國 FDA 不同,跨國比較要兩邊分別查。
通用 AI 助理 (5)
跨階段都用得上,但都不是資料庫
ChatGPT
覆蓋面最廣的通用 AI 助理
OpenAI 的對話式 AI 助理,可以上傳檔案、搜尋網頁、執行程式碼。不是學術專用工具,但什麼都能問,也是多數人的第一個 AI 工具。
什麼時候用解釋一個陌生名詞、把中文思路轉成英文、整理會議筆記這類雜事。
提醒:不要用它直接找文獻。這類通用模型沒有真的去查學術資料庫,很容易生出看起來很像真的、實際上不存在的引用。
Claude
擅長長篇文件的閱讀、寫作與改寫
Anthropic 的 AI 助理,一次能讀進較長的內容,支援檔案上傳與專案功能,長文的結構檢討與改寫是它的強項。
什麼時候用初稿寫完,需要有人幫你挑出邏輯斷掉的地方。
提醒:一樣不適合拿來直接檢索文獻,書目要自己核實。
Gemini
與 Google 文件、雲端硬碟整合的 AI 助理
Google 的 AI 助理,與 Google 文件、雲端硬碟、Gmail 深度整合,長篇文件與圖片、影片這類素材都處理得來。
什麼時候用研究材料都放在 Google 雲端硬碟,想直接讓 AI 讀。
提醒:個人帳號與學校帳號的資料處理條款不同,未發表內容要先確認自己登入的是哪一種。
Felo
繁體中文介面的 AI 搜尋,可直接轉成簡報
多語言 AI 搜尋工具,回答附來源連結,也能把搜尋結果直接生成簡報、心智圖與文件。介面支援繁體中文。
什麼時候用想把一個主題的中文與外文資料一次掃過,還要拿到一份能改的簡報。
提醒:免費版每天只有五次專業搜尋與三次檔案分析。付費採點數制,比較吃資源的功能扣點很快。查學術文獻仍要回專用資料庫核對。
Perplexity
每句回答都附來源的 AI 搜尋
對話式搜尋引擎,回答同步標出引用的網址,可以當場點進去核對,也能切換底層模型。
什麼時候用要快速搞懂一個陌生概念,而且需要看得到出處。
提醒:免費與 Pro 方案預設會用你的查詢紀錄訓練模型,要自己去帳號設定關掉。
常見問題
- 一次收這麼多工具,我該從哪一個開始?
- 從你現在卡住的那一步開始找,不用先把整份清單看懂。那排分頁可以直接切過去:還沒找到夠多文獻就點「搜尋文獻」;懷疑某個結論站不站得住腳,切到「引用與可信度查證」。篩選欄會疊在分頁上,例如切到某個階段再勾「免費」,看到的就是那個階段裡的免費工具。
- 只用免費工具做得完一份學位論文嗎?
- 做得完。Semantic Scholar 或 PubMed 找文獻、Zotero 管引用、Gemini Notebook 讀文獻、R 跑統計、Retraction Watch 查撤稿,這一整串都免費。付費工具買的主要是時間與完整功能,不是研究能力。
- 標「機構授權」的工具,學生是不是就用不到?
- 有機會用得到。Web of Science、Scopus、SciFinder、Reaxys、Embase、Cochrane、EndNote、Turnitin 這些,有些學校會訂閱,用學校網路、學校帳號或信箱就能使用。付費之前先查一下你的機構有沒有訂閱。
- 可以直接請 ChatGPT 幫我找文獻嗎?
- 可以問,但不要直接引用它給你的文獻清單。通用的聊天型 AI 不會真的去搜學術資料庫,很容易生出看起來很合理、實際上不存在的引用。「搜尋文獻」那一段的工具會把結果對回真的查得到的論文,風險低很多。不管用哪個工具,最後都回 PubMed 一筆一筆確認過。
- 未發表的實驗數據可以丟給這些 AI 工具嗎?
- 預設是不行,然後一個一個去確認。工具的官方條款會變,各校的規定也不一樣,動手前這兩邊都要查過。研究受 IRB 規範的話,上傳前先確認過。真的要求完全不外傳,只有裝在自己電腦上跑得起來的工具符合,像 Zotero、R、ImageJ、Cellpose 這一類。
- 這份清單多久更新一次?
- 工具跟收費方案變動很快,這頁我會持續修,最後更新日期標在上面。如果你發現哪一項已經過時了,歡迎跟我說。
