如何使用 SciSpace 進行文獻回顧？

在研究一個不熟悉或新的領域時，研究者首要任務是進行文獻回顧，然而文獻回顧的過程非常消耗時間與精神，需要閱讀多篇文獻，並花大量時間比較和思考文獻的論點。

這篇文章會用 SciSpace 這款工具，示範我如何透過 SciSpace Agent 輔助來幫助我進行文獻回顧的工作流。

內容目錄

什麼是 SciSpace？

SciSpace 是一款整合多種研究工具與功能的 AI 研究助手，幫助研究生與學術研究者加速研究進展。SciSpace Agent 可以幫我們進行文獻探索與回顧、寫論文草稿、建立投影片等等。

如果你想進一步了解 SciSpace，可以看以下兩篇我寫的介紹文：

接下來，我會來分享我如何透過 SciSpace 來輔助我的研究工作流。

1. 建立研究地圖：快速建立 FXIa Inhibition 的研究地圖

我最近看到拜耳公佈了 Asundexian 三期臨床數據，讓我對這個 FXIa 抑制劑感興趣。近期 FXIa 抑制劑之所以受矚目，是因為它有望打破「抗凝血必增加出血風險」的傳統困境。

但這不是我的主要研究領域，所以我透過 SciSpace Agent 幫我了解這個抑制劑過去的研究發展與應用。

在開始讀任何一篇 FXIa inhibitor 的論文之前，我會先了解整個研究地圖。

過去我都會先找一篇 review paper 來了解該領域的相關知識，現在直接我可以透過 AI 來幫助我搜尋與整理這些資訊。

因此，我可以透過 SciSpace Agent 或其他 AI 工具進行文獻回顧，來了解 FXIa Ihibitor 的機制、種類，以及目前研究上與臨床上的發展。

以下是我的提示詞，並使用 SciSpace BioMed Agent 來示範：

Provide an scientific review on Factor XIa (FXIa) inhibition as a therapeutic strategy.
Summarize:
1. Key biological rationale
2. Major classes of FXIa inhibitors
3. Current clinical development stages
4. Open questions or controversies in the field

通常使用 SciSpace Agent 需要花一點時間，等它生成報告。

最終它會根據你的提示詞要求，生出一份長篇的報告。

但我發現輸出結果有時會沒有附上文獻來源，你還需要額外請求它把報告中提到的文獻列出來。這可能就跟你提示詞有沒有下得精準有關，至少需要多跟它對話幾回才能得出滿意的成果。SciSpace Agent 也無法僅憑一次提示詞就給出令你滿意的結果。

不過，這依舊改變我們進行文獻回顧的過程。

過去我們可能是一篇一篇抓 paper、review paper，再從中找出與機制、藥物設計、 clinical trial 等有關的 paper，像拼圖一樣，慢慢在腦中拼湊出完整的全貌。

現在，我們可以透過 AI Agent 來幫助你研究目前領域，知道哪些領域值得繼續鑽研，避免走了歪路，才發現這個研究沒什麼價值。

2. 多篇論文比較與分析：Multi-PDF 分析，跨文獻比較 FXIa inhibitors 的 efficacy 與 safety

雖然 SciSpace 已經收錄多篇文獻，但是有時最新的文獻並不一定在其中，所以如果你有該文獻的 PDF 檔案，就可以上傳到 SciSpace 讓 AI 幫你分析該篇文獻。

此外，AI 依舊可能會產生幻覺，所以若有給予文獻來源，較能夠根據那些文獻內容來做回答，進而減少幻覺的產生。

近期，SciSpace 可以一次上傳最多十篇 PDF 進行分析與比較，就如同 NotebookLM 般。

操作方式，如下圖所示：

5_SciSpace_upload multiple papers_summerize these files

使用這項功能的好處是，生成的報告會顯示引用自哪篇論文的哪個段落，不像 NotebookLM 因為將文獻轉成純文字檔，所以看引用來源時，所標記的位置很難閱讀。

而 SciSpace 則會透過原本的 PDF 檔案顯示具體段落位置，方便你確認資料來源的正確性。但是點擊 locate the PDF 後，其標示的位置不是很準確，希望能夠再優化，能夠更清楚地 highlight 引用自哪個段落。

此外，另外一種上傳文獻的方式，可以透過連結到你的書目管理軟體，像是 Zotero 和 Mendeley （未來還可以連到 OneDrive, Notion, Github, and Slack）。

我嘗試連結到 Mendeley 的帳號，首先點選 connects APPs，選擇 Mendeley，登入你的 Mendeley 帳號後，選擇 connect account，就成功將 Mendeley 的書目資料庫連結到 SciSpace 上。

我在 SciSpace 對話框輸入以下提示詞：

Summarize these papers about FXIa from my mendeley account.

SciSpace Agent 就會自動連到 Mendeley 搜尋書目庫中有關 FXIa 的文獻，這樣一來你不需要篩選需要的文獻再上傳 PDF 上去，而是直接從書目庫中搜尋，節省下許多時間。

3. 整理文獻回顧的結果：把文獻分析結果，轉成「可寫進文章」的段落

完成文獻回顧後，建議要將獲得的資訊轉換成筆記，在卡片盒筆記法中稱之為文獻筆記，是能夠幫助你回顧資料的來源。

當我閱讀完一篇文獻，我會紀錄從論文中得到的資訊與洞見，方便自己未來在撰寫研究報告、研究計會草稿、期刊論文、畢業論文、或是撰寫一篇新的部落格文章時，不用回頭一篇篇翻找文獻，還要重看過一便。

我會建議當你讀完一篇論文，就要寫下一些筆記在其他軟體上，例如 Notion 或 Heptabase，幫助未來的你快速回顧這篇論文的重點，到時候引用該篇文獻時，你不會因為忘了內容，而需要重新閱讀過一遍。這樣當你要發表論文、撰寫畢業論文時，能夠更快速、更省時省力。

像是當我看完，AI 生成的報告後，我會想要整理 FXIa 抑制劑的機制與臨床上的實驗證據，所以下了以下提示詞：

Based on the analyzed papers, draft a concise summary of:
1. The mechanism of FXIa inhibition
2. Current clinical evidence supporting its safety profile Ensure all statements are grounded in cited sources.

雖然你可以透過 AI agent 來協助你完成初稿，但我建議還是以自己的文字來寫一遍，除了會更有印象之外，也能鍛練邏輯思考能力，確保你真的有讀懂這篇文獻。

而且 AI 只能根據文獻提供的資訊作回答，真正的判斷還是要由人去做決策，例如我看完 FXIa 抑制劑: Asundexian 在三期臨床中與傳統藥物的優劣對比，AI 只能照實描述數據與文獻中的解讀，但唯有研究者能解讀其數據背後所隱藏的臨床意義。

結語

如果你平常需要同時處理大量文獻，又很在意 citation 的可回溯性，對於需要長時間做多篇文獻分析的人來說，這種「多篇文獻 + citation 可追溯」的設計，我會建議你實際試試看 SciSpace Agent 最新的 Multi-PDF 與 Mendeley 整合功能，另外它目前也可以連結到 Zotero。

如果你想要使用 SciSpace 進行文獻回顧，以下是我的優惠連結和折扣碼。

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